Herramientas moleculares aplicadas al monitoreo del control y eliminación de la rabia: caso Etiopía

Abstract

El trabajo aquí presentado comprendió el escrutinio de 366 muestras de animales domésticos (perros, gatos y ganado), animales silvestres (chacales, zorros y lobos) rabiosos, colectados a lo largo de todo el territorio etíope en el periodo 2010-2017. Se corroboró que todas las muestras fueran positiva a rabia por transcripción reversa acoplada a PCR tiempo real (LN34). Solamente las muestras que amplificaron a bajo número de ciclos de amplificación (menos de 25 ciclos), fueron consideradas para subsecuentes análisis. Se usó secuenciamiento nucleótido como herramienta para determinar la diversidad y distribución de focos de rabia asociados a perros y buscar ciclos de rabias asociados a animales silvestres. Un total de 230 secuencias, 187 para el gen parcial y 43 para el gen completo de la nucleoproteína se usaron para hacer árboles filogenéticos (árboles genealógicos), que también incluyeron secuencias de referencia del banco de genes de todo el continente africano para hacer una comparación robusta (GenBank). Se logró construir un catálogo de diferentes variantes genéticas del virus de la rabia principalmente asociados a perros.